张军，博士，深圳大学助理教授、特聘副研究员，深圳市鹏城孔雀C类人才，中国计算机学会（CCF）生物信息学专委会通讯委员、“新未来”青年学者研讨会（Bio3New）执行委员。主要从事生成式人工智能与生物大分子药物设计交叉领域相关研究。以第一/通讯作者在Nature Biotechnology、Trends in Genetics、Bioinformatics、AAAI等国际权威期刊及会议发表学术论文20余篇，1篇入选ESI高被引论文。主持国家自然科学基金青年项目、广东省基础与应用基础研究基金面上项目、深圳市高精尖紧缺人才启动项目、大数据国家工程实验室开放课题重点项目。获广东省卓越人工智能与机器人奖一等奖、深圳大学2024年十大科技进展、哈尔滨工业大学优秀毕业生等荣誉和奖项。兼任Communication Biology、Briefings in Bioinformatics、AAAI在内的多个期刊审稿人/会议程序委员。
教育背景
2018年-2022年，哈尔滨工业大学（深圳），计算机应用技术，博士
2016年-2018年，哈尔滨工业大学（深圳），计算机科学与技术，硕士
2012年-2016年，河南科技大学，信息管理与信息系统，学士
工作经历
2023年-至今，深圳大学人工智能学院，助理教授
2024年-至今，深圳大学人工智能学院，特聘副研究员
研究课题
生物语言大模型及其在生物分子结构与功能分析中的应用
生成式人工智能及功能性生物大分子（RNA/多肽）设计
招2026级硕士研究生2名，联合培养博士研究生1名，欢迎对上述方向感兴趣的同学报考。
具体要求：为人正直，勤奋踏实，有较强的编程能力以及较为独立的思考能力。
可以提前进入课题组实习，感兴趣的童鞋可Email联系☺。
部分研究成果（*通讯作者）
1. Jun Zhang*, Ju Zhang, Shaoxuan Tang, Chuancheng Liu, Yushan Cai, Hao Zeng, Xiangjie Meng, Yang Zhang*, Yu Wang*. One Round Evolution of RNA Aptamers with GRAPE-LM. Nature Biotechnology, 2025. （Accepted in Principle and Selected for Research Briefing，自然指数期刊，影响因子：41.7）
2. Jun Zhang, Mei Lang, Yaoqi Zhou*, Yang Zhang*. Predicting RNA Structures and Functions by Artificial Intelligence. Trends in Genetics, 2024, 40(1): 94-107. (Cell旗下子刊，影响因子：16.3)
3. Jun Zhang*, Yangyang Zhou, Tiantian Zhu, Zexuan Zhu*. PepCCD: A Contrastive Conditioned Diffusion Framework for Target-Specific Peptide Generation. Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence, 2026. (Accepted, CCF A类会议)
4. Jun Zhang*, Xueer Weng, Tiantian Zhu, Yumeng Liu, Zexuan Zhu*. Molecular-Level Protein Semantic Learning via Structure-Aware Coarse-Grained Language Modeling. Bioinformatics, 2025, btaf654. (CCF B类期刊，影响因子：5.4)
5. Jun Zhang*, Hao Zeng, Junjie Chen*, Zexuan Zhu. INAB: Identify Nucleic Acid Binding Domain via Cross-Modal Protein Language Models and Multiscale Computation. Briefings In Bioinformatics, 2025, 26(5):bbaf509 (CCF B类期刊，影响因子：7.7)
个人主页：https://www.researchgate.net/profile/Jun-Zhang-222
指导研究生
2023级：
1. 曾浩，在Nature子刊NBT、生信顶级期刊BIB、会议BIBM各发表论文一篇，获研究生国家奖学金
2. 翁雪儿，在生信顶级期刊Bioinformatics发表论文一篇，获批发明专利一项
3. 唐少轩，在Nature子刊NBT发表论文一篇
2024级：
1. 李嘉豪，申请发明专利一项
2. 周杨洋，在人工智能顶级会议AAAI发表论文一篇
3. 何思怡，生信顶级期刊BIB论文一篇在投
4. 冯焕超，在CCF B类会议BIBM发表论文一篇
